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细胞划痕的面积怎么定量统计?此神器助你发高分

最近在投稿?在写标书?细胞划痕的面积不知道怎么定量统计啊!

细胞划痕(Wound healing)实验是什么鬼?研究细胞侵袭、迁移能力必备啊。

 用枪头哗啦两下,测量侵袭的宽度?Out


人为地在单层贴壁细胞上划出一条笔直、粗细均匀的“伤痕”,只要计算出不同实验组前后划痕面积的比值即可比较侵袭以及迁移能力强弱。

别人家高分文章的图是这个样子的,是不是很高阶?

 峰值计算?迁移热点都能展示吗?


今天给大家先介绍一下划痕的面积计算,并不是用尺子量!

此神器就是…还是…神通的

Image J!Image J!Image J!

 它法力无边:可用于分析DNA电泳和western blotting条带的灰度值,细胞计数,细胞共定位,细胞划痕面积……

使尽洪荒之力,终于让本仙get到如下方法,现倾情分享给大家,拿走不谢!

我们就来细致的学习一下如何用它来计算细胞划痕面积(简单7步,保证你能学会哦)

1、导入图片:File→open:打开要测量的划痕图

 

2、转换图片格式:Image→Type→8-bit (调成灰度图片,此步骤非常重要,必须转换)

3、找到划痕边缘:Process→Find Edges


4、加强对比:Process→Sharpen

PS:此步骤截图看起来没有在电脑上实际操作明显,但很重要

 

5、Image→Adjust→Threshold

A红框:设置Default为B&W,即默认值为黑&白;

B绿框:适当调节绿框中的值使细胞的亮度更明显(也可以使用默认值,调节的终点以划痕中间出现零星白点为佳),如本例中从默认67调到了61,效果如下:

6、再重复步骤3,即Process→Find Edges,效果如下图:

然后将下图操作界面直接关掉:

 

7、结果分析:Analyze→Analyze Particles

将1框中参数改为10000-Infinity

将2中Display Results、Summarize以及Add to Manager打钩

将3中Show值参数改为Outlines

最后点击OK

 

8、结果出来啦:

上图左蓝色曲线包围的面积即为测量的划痕区,中间为划痕区示意图,右图红色框内的数值即为我们测得的划痕区面积值。

 

本人分享完了,你学会了吗?

 

Image J软件下载地址:

链接:http://pan.baidu.com/s/1o83LiEQ 密码:2ojb

 

相关阅读:

参考文献:

A molecular mechanotransduction pathway regulates collective migration of epithelial cells.Nature Cell Biology.

 

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