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作出SCI论文中的table 1 原来这么简单!

在中英文论文中,表1 都是对基本信息的描述,根据不同的研究设计,有不同的格式。但总体包括了以下几个方面,流行病学资料,重要的协变量,以及自变量和结局指标。当表1内容较少的时候,可以一个个使用软件计算,然后填入,但是当数据量比较大的时候,就容易出错了。

今天给大家分享一下如何使用R语言完成表1的设计。

library(tableone)
library(survival)    首先是加载tableone包,使用survival包中的pbc数据集进行演示 
data(pbc)
head(pbc)

查看pbc数据集的数据

varsToFactor <- c("status","trt","ascites","hepato","spiders","edema","stage") pbc[varsToFactor] <- lapply(pbc[varsToFactor], factor)

将分类计数资料进行因子化。

dput(names(pbc)) vars <- c("time","status","age","sex","ascites","hepato",           "spiders","edema","bili","chol","albumin",           "copper","alk.phos","ast","trig","platelet",           "protime","stage")

生成拟展示的变量


tableOne <- CreateTableOne(vars = vars, strata = c("trt"), data = pbc)



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