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RNA测序究竟有多可靠呢


公众号关于转录组实战的教程实在是太多了,我都懒得给你们整理目录:

你应该明白如何在我们公众号进行搜索,这个技巧很重要。
不过,不少粉丝反映我们的教程太实用了,反而忽略了基础概念,唉,概念这东西,不需要我们来讲解了,主要靠自学,多看文献。
所以推荐下面这个文章给大家:
由美国FDA牵头的测序质量控制(SEQC)项目对RNA测序的准确性、可重现性和信息含量进行了综合性评估。其初步调查结果发表在2014年09月的Nature Biotechnology杂志上,石乐明教授是这篇文章的通讯作者之一。研究人员用RNA参照样本在全球多个实验室的Illumina HiSeq、Life Technologies SOLiD、Roche 454平台上进行检测,主要评估RNA测序在接头区域和差异性表达谱中的表现,并将其与芯片和定量PCR(qPCR)进行比较。研究表明,数据分析的算法会对RNA测序产生很大影响,不同算法生成的转录本数据存在很大差异。



文章是:A comprehensive assessment of RNA-seq accuracy, reproducibility and information content by the Sequencing Quality Control Consortium,by SEQC/MAQC-III Consortium – ‎2014





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